Pelabuhan Marunda adalah Pelabuhan Khusus yang diperuntukkan untuk Pelabuhan Pusat Perkayuan sesuai Surat Keputusan Menteri Perhubungan Nomor : KP.5/AL.003/PHB-90 tanggal 10 April 1990 kemudian terbitlah Peraturan Pemerintah Republik Indonesia Nomor : 31 Tahun 1990 tentang Pembubaran PT. (Persero) Pusat Perkayuan Marunda dan Penambahan Penyertaan Modal Negara Hasil Likuidasi Perusahaan Perseroan tersebut ke dalam modal saham PT. (Persero) Kawasan Berikat Nusantara.

SEJARAH
Beroperasinya Pelabuhan Marunda sedikit banyak mengurangi beban aktivitas bongkar muat di Pelabuhan Tanjung Priok yang begitu padat. Keberadaan Pelabuhan Marunda memang cukup istimewa. Pasalnya, infrastruktur tersebut dibangun tanpa menggunakan uang negara sepeser pun. Bahkan, pemerintah melalui Kementerian Perhubungan menetapkan proyek pembangunan Pelabuhan Marunda tersebut sebagai pilot project alias percontohan proyek infrastruktur yang dibangun dengan sumber biaya non APBN maupun APBD. Maka dari itu, pelabuhan yang dibangun oleh perusahaan patungan (joint venture) Badan Usaha Pelabuhan (BUP) Karya Citra Nusantara ( KCN) itu masuk daftar proyek strategis nasional. Adapun KCN merupakan perusahaan kerja sama antara PT Karya Tekhnik Utama ( KTU) dengan PT Kawasan Berikat Nusantara (Persero) atau KBN. Pada 2017 lalu, Kementerian Perhubungan pernah merekomendasikan proyek percontohan tersebut untuk diresmikan Presiden Joko Widodo.

Pada 2004 lampau, KBN saat itu mencari mitra bisnis untuk membangun Pelabuhan Marunda. Melalui proses tender, PT Karya Tekhnik Utama (KTU) terpilih sebagai pemenang pengembang kawasan C01 Marunda. Lantas, KBN dan KTU membentuk perusahaan patungan yang dinamai PT Karya Citra Nusantara (KCN) pada 2005. Pendirian KCN sendiri disetujui Menteri BUMN dan Pemerintah Provinsi DKI Jakarta selaku pemegang saham KBN.