Pelabuhan Dofa merupakan satu satunya Pelabuhan Rakyat yang menghubungkan  kabupaten Halmahera Barat dengan Kota Ternate. Dufa-Dufa merupakan salah satu kelurahan di kecamatan Ternate Utara, kota Ternate, provinsi Maluku Utara, Indonesia.

SEJARAH 

Sultan Mudzaffar Syah adalah raja kelima dari Kesultanan Melaka. Dia menggantikan saudara seayahnya, Raja Ibrahim atau Seri Parameswara Dewa Syah. Pada masa pemerintahannya Malaka mulai melaksanakan perang ekspansi ke negeri negeri tetangganya, dan berhasil menundukkan Manjong, Selangor, Batu Pahat, Kampar dan Indragiri. Hal ini mengundang kemarahan Siam yang menyerbu Malaka dua kali, tahun 1445 melalui Pahang dan tahun 1456 melalui laut. Mudzaffar Syah digantikan putranya, Raja Abdullah (Sultan Mansur Syah).

Perubahan nama pelabuhan Dufa-Dufa menjadi Sultan Mudaffar Syah dinilai penting sebagai sebuah bentuk manifestasi guna mengenang pilar perjuangan kesultanan Ternate pada masa kejayaannya. Alasan lain perubahan nama ini merupakan sebuah refleksi untuk menunjukan eksistensi history atau sejarah kesultanan Ternate. Ditambah dengan beberapa jabatan penting yang disandang Sultan, itu sebabnya pergantian nama menjadi Mudjafar Syah merupakan bukti nyata untuk dikenal di Nusantara Indonesia.